90年，他又以卫冕者的角色参加了世界杯的比赛。这届世界杯的举办地在意大利，当时马拉多纳正在那不勒斯队效力，其间他帮助该队赢得了两次意甲联赛冠军和一次欧洲联盟杯冠军(uefacup)。尽管由于严重的踝伤他的体力有所下降，但作为领军人物，他所保持的强烈的求胜**帮助他的球队一一战胜了巴西队、南斯拉夫队和意大利这些强硬的对手。然而布雷默(andreae)的点球帮助德国队最终夺冠。在国家队中，马拉多纳91次出场完成的34个进球。
马拉多纳的最后一次世界杯经历也是最糟糕的一次。在1994年的美国，他帮助阿根廷战胜了希腊队和尼日利亚队。然而，由于在兴奋剂检查中被检出服用了禁用的麻黄素，他被取消了比赛身份。随后，没有了主心骨的阿根廷队接连负于保加利亚队和罗马尼亚队，提前退出了世界杯赛场。对尼日利亚的比赛是马拉多纳代表国家队的比赛，他共为国家队出场91次进34球。
2001年10月10日，在博卡青年队的主场labombonera体育场，阿根廷人为马拉多纳美丽但褒贬不一的足球生涯举行了告别比赛。身穿10号球衣的马拉多纳率领国家队战胜了世界全明星队。也许有人会说这不过是遵循惯例，但这一次主题有所不同：它表达了阿根廷对她最喜爱的足球之子的安慰。
成功后的马拉多纳也遭到了不少非议。他的拥护者用“诚实”和“拒绝背叛”为他辩解，而他的批评者也不乏贬低他的素材：他毕竟曾用气枪朝记者射击，还在国家级的电视节目上辱骂教皇，他总能让人对他既爱又恨。然而在球场上，马拉多纳是不折不扣的王者，他不过是在做着自己喜欢的事情，但对别人来说那也许穷其一生也无法办到。法国足坛巨星普拉蒂尼(mibsp;pl这样称赞马拉多纳的天赋：“我在球场上所能做的事情，对他来说就象摆弄一个橘子一样毫不费力。”
当人们发现没有了马拉多纳之后的世界足坛日渐凋零、星光暗淡之后，才开始怀念起这位百年来足球史上最伟大的球星，而当初将这位球技出神入化、炉火纯青的“绿茵之神”臭骂得一钱不值的也是这些人。
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